З початку пандемії діагностичне тестування відіграло життєво важливу роль у контролі поширення SARS-CoV-2, вірусу, який викликаєCOVID 19.Швидкі тести на антигенвиконується вдома або в клінічних умовах, дає результати за 15 хвилин або менше.Чим раніше людині буде поставлено діагноз, тим швидше вона зможе звернутися за медичною допомогою та ізолюватися від інших.Але коли з’являються нові варіанти вірусу, ці варіанти можуть не бути виявлені цими тестами.
Більшість експрес-тестів на антиген розроблено для виявлення білка нуклеокапсиду SARS-CoV-2 або N-білка.Цей білок міститься у великій кількості у вірусних частинках та інфікованих людях.Набір для швидкого тестуваннязазвичай містять два різних діагностичних антитіла, які зв’язуються з різними частинами білка N.Коли антитіло зв’язується з білком N у зразку, на тестовому наборі з’являється кольорова лінія або інший сигнал, що вказує на інфекцію.
Білок N складається з 419 амінокислотних структурних одиниць.Будь-яка з них може бути замінена іншою амінокислотою шляхом мутації.Наукова група під керівництвом к.б.н.Філіп Франк і Ерік Ортлунд з Університету Еморі вирішили дослідити, як зміна однієї амінокислоти впливає на продуктивність швидкого тесту на антиген.Вони використовували техніку, яка називається глибоким скануванням мутацій, щоб одночасно оцінити, як кожна мутація в білку N вірусу впливає на зв’язування з діагностичним антитілом.Їх результати були опубліковані в Cell 15 вересня 2022 року.
Дослідники створили повну бібліотеку з майже 8000 мутацій білка N.На ці варіанти припадає понад 99,5% усіх можливих мутацій.Потім вони оцінили, як кожен варіант взаємодіє з 17 різними діагностичними антитілами, використовуваними в 11 комерційно доступних експрес-тестах на антиген, включаючи звичайнідомашні набори.
Команда оцінила, які мутації N-білка впливають на розпізнавання антитіл.Грунтуючись на цій інформації, вони створили «профіль евакуаційної мутації» для кожного діагностичного антитіла.Цей профіль ідентифікує специфічні мутації в білку N, які можуть вплинути на здатність антитіла зв’язуватися зі своєю мішенню.Аналіз показав, що антитіла, які використовуються в сучасних швидких тестах, розпізнають і зв’язують усі минулі та нинішні варіанти SARS-CoV-2, що викликають занепокоєння та занепокоєння.
Незважаючи на те, що кілька діагностичних антитіл розпізнають ту саму область білка N, дослідники виявили, що кожне антитіло має унікальну ознаку мутацій, що втікають.Оскільки вірус SARS-CoV-2 продовжує мутувати та створювати нові варіанти, ці дані можна використовувати для позначення антитіл у тестовому наборі, які, можливо, потребують повторної оцінки.
«Точна та ефективна ідентифікація інфікованих осіб залишається критично важливою стратегією пом’якшення наслідків COVID-19, і наше дослідження надає інформацію про майбутні мутації SARS-CoV-2, які можуть перешкоджати виявленню», — сказав Ортлунд.«Описані тут результати дозволяють нам швидко адаптуватися до цього вірусу, оскільки нові варіанти продовжують з’являтися, що має безпосередні клінічні наслідки та наслідки для громадського здоров’я».
Довідкова інформація: Глибоке сканування мутацій виявляє мутації, що вислизають, у нуклеокапсиді SARS-CoV-2 за допомогою доступних на даний момент швидких тестів на антиген.Френк Ф., Кін М.М., Рао А., Бассіт Л., Лю Х., Боуерс Х.Б., Патель А.Б., Като М.Л., Салліван Дж.А., Грінліф М., Піантадосі А., Лам В.А., Хадсон В.Х., клітина Ортлунда Е.А.15 вересня 2022 р.; 185 (19): 3603-3616.e13.Міністерство внутрішніх справ: 10.1016/j.cell.2022.08.010.29 серпня 2022 р. PMID: 36084631.
Фінансування: Національний інститут біомедичної візуалізації та біоінженерії NIH (NIBIB), Національний інститут діабету, захворювань органів травлення та нирок (NIDDK) і Національний інститут алергії та інфекційних захворювань (NIAID), Американська кардіологічна асоціація.
NIH Research Matters — це щотижневе оновлення ключових результатів досліджень NIH, перевірених експертами NIH.Він опублікований Управлінням зі зв’язків із громадськістю Директора Національного інституту охорони здоров’я.